Ele é um dos alvos da investigação sobre uso irregular de um sistema secreto de monitoramento de geolocalização de celulares durante o governo de Jair Bolsonaro.
Fortunato Pinto foi afastado das funções pelo ministro Alexandre de Moraes. Ele atuou durante o governo de Bolsonaro como diretor de Operações de Inteligência da agência —área responsável por adquirir e manusear o software cujo uso é investigado.
O dirigente afastado foi nomeado como secretário de Planejamento e Gestão, o terceiro cargo mais alto na estrutura da Abin, pelo atual chefe da agência, Luiz Fernando Corrêa, quando ainda não era investigado.
De acordo com o currículo divulgado no site da Abin, Fortunado Pinto é formado em ciências econômicas e dentro da área de inteligência tem experiência em contrainteligência, contraterrorismo e análise do crime organizado transnacional.
Além de ocupar o Departamento de Operações de Inteligência na gestão Bolsonaro, ele já foi diretor do Departamento de Contrainteligência e diretor interino do Departamento de Inteligência Estratégica.
Ele também foi representante da Abin no Coaf (Conselho de Controle de Atividades Financeiras) e no Conad (Conselho Nacional Antidrogas) e adido de Inteligência na Embaixada do Brasil na Argentina no período de 2010 a 2011.
Ainda segundo os dados da agência, ele foi coordenador da Abin em eventos como Rio+20, Copa do Mundo (2014) e Olimpíadas e Paralimpíadas do Rio.
